Archeologen, brandweerlieden en zeelieden leven in de schaduw van de Vesuvius. In Napels en Pompeii beeft de aarde, terwijl het oude verleden het dagelijks leven van de inwoners doordringt.
Tussen de Vesuvius en de Golf van Napels beeft het land zo nu en dan. De ruïnes die onder het land liggen – Pompeii, Herculaneum, en lang geleden onder water verdwenen Romeinse villa's – vertellen het verhaal van een toekomst die door de tijd is begraven. Uit de sporen van de geschiedenis, herinneringen aan de ondergrondse wereld, in zwart-wit, komt een minder bekend Napels tevoorschijn.
De beeldschoon gefotografeerde documentaire Below the Clouds belicht een gebied dat doorkruist wordt door inwoners, gelovigen, toeristen en archeologen die het verleden opgraven – en door hen die er in musea naar streven om beelden, fragmenten en ruïnes nieuw leven en betekenis te geven. De trein die rond de Vesuvius rijdt, maakt zijn rondjes terwijl renpaarden langs de kust trainen. Een leraar runt een geïmproviseerde naschoolse opvang voor kinderen en jongeren. Brandweerlieden in hun commandocentrum proberen de angsten van de lokale bevolking die belt te sussen. De politie achtervolgt grafrovers, terwijl in Torre Annunziata Syrische tankers Oekraïens graan lossen.
Een team Japanse archeologen zet hun twintig jaar durende opgraving van Villa Augustea voort en haalt geschiedenis uit zaden, botten en sedimentlagen. Toeristen dwalen door de ruïnes van Pompeii en gelovigen knielen neer in de kerk van de Madonna dell'Arco, waar de crypten en votiefgeschenken getuigen van het geloof in een wereld die heeft overleefd.